Hinn (ó) venjulegi grunur um skáldsögu uppruna Coronavirus

A nýleg rannsókn skilgreinir á ný kórónaveira sem ber ábyrgð á lungnabólgufaraldrinum í Hubei héraði í Kína—Vírgjafaupprunaveiran tengist öðrum þekktum sjúkdómsvaldandi kransæðavírusum

The 2019 ný kórónaveira (CoV) veldur banvænni lungnabólgu sem hefur kostað yfir 1300 líf, með meira en 52000 staðfest tilfelli af smiti af 13. febrúar 2020, allt á rúmum mánuði. En, hvað er þessi vírus? Er það ný vírus alveg? Hvaðan kom það? Vísindamenn frá helstu rannsóknarstofnunum í Kína tóku sig saman til að svara þessum spurningum og þessi frumkvöðlarannsókn hefur verið gefin út árið Kínverskt læknablað.

https://www.youtube.com/watch?v=jFKWluuMdgs

Í byrjun desember byrjuðu nokkrir íbúar í borginni Wuhan í Hubei héraði í Kína að veikjast eftir að hafa farið á sjávarútvegsmarkað á staðnum. Þeir fundu fyrir einkennum eins og hósta, hita og mæði, og jafnvel fylgikvillum sem tengjast bráðu öndunarerfiðleikaheilkenni (ARDS). Greiningin strax var lungnabólga, en nákvæm orsök var óútskýrð. Hvað olli þessu nýja braust út? Er það alvarlegt brátt öndunarfærasjúkdómur (SARS) -CoV? Er það öndunarheilkenni Miðausturlanda (MERS) -CoV? Eins og kemur í ljós höfðu vísindamenn farið í rannsókn til að bera kennsl á þessa vírus í desember eftir að hafa greint fyrstu tilvikin. Þessi rannsókn er nú birt í Kínverskt læknablað og hver veiran hefur verið staðfest - hún er alveg ný vírus, nátengd kylfu SARS eins og CoV. Dr. Jianwei Wang (kínverska læknadeildin, Institute of Pathogen Biology), aðalrannsakandi rannsóknarinnar, segir: „Blað okkar hefur staðfest hver kylfuuppruni CoV var óþekktur fyrr en nú."

Í þessari rannsókn uppgötvuðu og greindu vísindamenn frá þekktum rannsóknarstofnunum í Kína, svo sem Kínversku læknavísindastofnuninni, Institute of Pathogen Biology, China-Japan Friendship Hospital og Peking Union Medical College, og greindu nýja CoV - aðal sökudólga útbrotið í Wuhan — eftir næstu kynslóðaröðun (NGS). Þeir einbeittu sér að fimm sjúklingum sem voru lagðir inn á Jin Yin-tan sjúkrahúsið í Wuhan, en flestir þeirra voru starfsmenn á sjávarfangsmarkaðnum Huanan í Wuhan. Þessir sjúklingar voru með mikinn hita, hósta og önnur einkenni og voru upphaflega greindir með lungnabólgu en af ​​óþekktum orsökum. Ástand sumra sjúklinga versnaði hratt til ARDS; einn dó jafnvel. Dr Wang segir, „Röntgenmyndir af bringu sjúklinganna sýndu nokkur þoka ógagnsemi og þéttingu, sem eru dæmigerð fyrir lungnabólgu. Við vildum hins vegar komast að því hvað olli lungnabólgu og tilraunir okkar í kjölfarið leiddu í ljós nákvæmlega orsökina— Nýtt CoV sem ekki var þekkt áður."

Til rannsóknarinnar notuðu vísindamennirnir vökvasýni úr berkju- og lungnaskolun (BAL) sem tekin voru frá sjúklingunum (BAL er aðferð þar sem sæfður vökvi er fluttur í lungun í gegnum berkjuspegil og síðan safnað til greiningar).

Í fyrsta lagi reyndu vísindamennirnir að bera kennsl á veiruna með erfðamengisröðun með NGS tækni. NGS er ákjósanleg skimunaraðferð til að bera kennsl á óþekkt sýkla vegna þess að það uppgötvar og útilokar fljótt allar þekktar smitandi örverur í sýninu. Byggt á raðgreiningu á DNA / RNA úr BAL vökvasýnum komust vísindamenn að því að flestir veirulestrar tilheyrðu CoV fjölskyldunni. Vísindamennirnir settu síðan saman mismunandi „les“ sem tilheyrðu CoVs og smíðuðu heila erfðamengingaröð fyrir nýju vírusinn; þessar raðir voru 99.8-99.9% svipaðar í öllum sýnum sjúklinganna, sem staðfestir að þessi vírus var algengur sýkillinn hjá öllum sjúklingunum. Ennfremur, með því að nota samheitalifagreiningu, þar sem erfðamengisröð er borin saman við aðrar þekktar erfðamengisraðir (með fyrirfram ákveðinn þröskuld 90% til að hún geti talist „ný“ röð), staðfestu þeir að erfðamengisröð þessarar nýju vírusar er 79.0% svipað og SARS-CoV, um 51.8% svipað og MERS-CoV, og um 87.6–87.7% svipað og önnur SARS-svipuð CoV frá kínverskum hestakylfum (kölluð ZC45 og ZXC21). Fylogenetic greining sýndi að röðin af fimm CoV stofnum sem fengust voru næst þeim sem fengnir voru frá kylfum, en mynduðu aðskildar þróunargreinar. Þessar niðurstöður benda greinilega til þess að vírusinn sé upprunninn frá leðurblökum. Dr Wang segir: „Vegna þess að líkindi vírusafritunargensins við allar aðrar þekktar „svipaðar“ vírusar eru enn innan við 90% og að teknu tilliti til niðurstaðna fylogenetic greiningar teljum við að þetta sé örugglega nýtt, áður óþekkt CoV. Þessi nýja vírus er tímabundið kallaður 2019-ncov."

Að síðustu fóru vísindamennirnir að „einangra“ vírusinn frá BAL vökvasýnum með því að athuga hvort vökvasýni sýndu frumufarandi áhrif á frumulínur á rannsóknarstofunni. Frumurnar sem voru útsettar fyrir vökvasýnum komu fram í rafeindasmásjá og vísindamennirnir fundu einkennandi CoV-lík mannvirki. Þeir notuðu einnig ónæmisflúrljómun - tækni sem notar sérstök mótefni merkt með flúrliti. Til þess notuðu þeir sermi frá sjúklingunum sem voru á batavegi (sem innihéldu mótefni), sem hvarfast við veiruagnirnar inni í frumunum; þetta staðfesti að þessi vírus var örugglega orsök sýkingarinnar.

Þessi rannsókn ryður brautina fyrir framtíðarrannsóknir til að skilja veiruna og upptök hennar betur, sérstaklega í ljósi hraðrar útbreiðslu hennar, getu hennar til að valda banvænum ARDS og skelfingu sem orsakast af braustinni. Þrátt fyrir að 4 af 5 sjúklingum sem þessi vírus var greindur frá voru frá sjávarafurðamarkaði í Wuhan, þá er ekki vitað nákvæmlega um smit. CoV gæti hafa verið smitað til manna í gegnum „millistig“ burðarefni, svo sem þegar um er að ræða SARS-CoV (lófakæfukjöt) eða MERS-CoV (úlfalda). Dr Wang segir að lokum: „Öll CoV-gildi manna eru dýrasýkjandi og nokkur mannleg CoVs eru upprunnin frá leðurblökum, þar á meðal SARS- og MERS-CoVs. Rannsókn okkar sýnir glögglega brýna þörf á reglulegu eftirliti með flutningi kvíða frá kylfu til manna. Tilkoma þessarar vírus er gífurleg ógn við lýðheilsu og því er það afar mikilvægt að skilja uppruna þessarar vírus og ákveða næstu skref áður en við verðum vitni að stærri brotthvarfi. "