Nýjar rannsóknir fyrir ristilkrabbameinssjúklinga

Caris Life Sciences® á að kynna niðurstöður sem veita dýpri skilning á því að æxlistjáning gena sem tengist umfangi lyfjaútsetningar, lagskipt eftir p53 stöðu, tengist klínískum niðurstöðum á algengum krabbameinslyfjameðferðum sem notuð eru til að meðhöndla ristilkrabbamein með meinvörpum (CRC). Þessar niðurstöður verða kynntar á 2022 American Association for Cancer Research (AACR) ársfundi sem haldinn er 8. – 13. apríl 2022 í New Orleans, Louisiana.

Rannsóknin með veggspjaldinu sem ber titilinn „Forspár og forspár lyfjaframkallaðar genundirskriftir fyrir ristilkrabbameinssjúklinga sérsniðnar út frá p53 stöðu og meðferð með FOLFOX, 5-FU, oxaliplatin eða irinotecan“ (ágrip #1231), var stýrt af Wafik El-Deiry , MD, Ph.D., FACP, forstöðumaður Legorreta krabbameinsmiðstöðvar Brown háskóla, aðstoðardeildarforseti við Warren Alpert læknaskólann, meðlimur í Caris' Precision Oncology Alliance (POA). POA Caris er vaxandi net leiðandi krabbameinsmiðstöðva um allan heim sem vinna saman að því að efla nákvæma krabbameinsfræði og lífmerkjadrifnar rannsóknir. Þetta verk er kynnt í New Orleans af Lindsey Carlsen, útskriftarnema í meinafræði í EL-DEIRY Lab í Brown.

Markmið þessarar rannsóknar var að bera kennsl á forspárlífmerki fyrir krabbameinslyf sem notuð eru við CRC. Rannsóknin notaði CRC frumulínur til að bera kennsl á mismunandi tjáð gen eftir 5-flúoróúracíl, irinotecan eða oxaliplatín meðferð og lagskipt undirskriftirnar út frá p53 stöðu. Úr þessum in vitro rannsóknum könnuðu vísindamennirnir síðan hvort þessi gen og genamerki gætu sagt fyrir um útkomu CRC sjúklinga eftir krabbameinslyfjameðferð (FOLFOX, 5-fluorouracil, irinotecan eða oxaliplatin). 2,983 villigerðarsýni og 6,229 p53 CRC sjúklingasýni með tap á virkni voru greind með DNA/RNA næstu kynslóðar raðgreiningu hjá Caris Life Sciences. Raunverulegar niðurstöður um lifun voru ályktaðar út frá gögnum um tryggingarkröfur og mati Kaplan-Meier. Bæði forspár og óforspár genatjáning hafði marktæk áhrif á lifun eftir sértæka lyfjameðferð.

„Þessi rannsókn hjálpar okkur að skilja mikilvægi genaundirskrifta til að sýna fram á aukna forspárhæfileika samanborið við einstök afrit,“ sagði El-Deiry. „Þessar rannsóknir sem brúa grunnrannsóknir og klínískar rannsóknir gera okkur kleift að skilja betur hvaða meðferðir eru líklegri til að gagnast CRC sjúklingum. Rannsóknin leiddi í ljós að æxlistjáning gena sem tengjast útsetningu fyrir lyfjum getur spáð fyrir um niðurstöður eftir krabbameinslyfjameðferð:

• Hátt EGR1 og FOS mRNA spá sjálfstætt fyrir um svörun við FOLFOX hjá sjúklingum með villigerð p53 æxli.

• Lágt CCNB1 mRNA er í samræmi við góðar horfur CRC sjúklinga með æxli sem geyma TP53 tap á stökkbreytingum á starfsemi.

• Lítil tjáning BTG2 spáir fyrir um betri horfur hjá sjúklingum með MSI-High TP53 stökkbreytt æxli.

• Genaundirskriftir geta sýnt fram á aukna forspárhæfileika samanborið við einstök umritunaráhrif.

„Caris einbeitir sér að lífmerkjum sem geta sagt fyrir um svörun sjúklinga við nýjustu meðferðum, en einnig sannreyndum krabbameinslyfjum eins og FOLFOX,“ sagði W. Michael Korn, læknir, yfirlæknir hjá Caris. „Við erum spennt að sjá þýðingarannsóknargetuna sem styrkist af hinum gríðarlegu fjöl-omic gögnum og greiningartækjum sem Caris hefur þróað og heldur áfram að taka framförum í.

Alhliða sameindasnið Caris metur heilt exóm (DNA), heilt umrit (RNA) og prótein tjáningu, sem veitir óviðjafnanlega auðlind og tilvalið leið til að framkvæma þýðingarrannsóknir til að flýta fyrir uppgötvun fyrir uppgötvun, greiningu, eftirlit, meðferðarval og lyfjaþróun að bæta ástand mannsins.

Caris mun kynna frekari gögn úr rannsóknum sem sýna fram á mikilvægan þátt nákvæmnislækninga og sameindaprófunar í meðferð krabbameins. Allar kynningar verða aðgengilegar á netinu í gegnum heimasíðu Caris frá og með 8. apríl 2022.

Viðbótarkynningar sýna áhrif alhliða sameindaprófunar og hugsanlegrar klínískrar framkvæmdar

• Alhliða lýsing á FGF/FGFR breytingum í ífarandi brjóstakrabbameini (ágrip #5793) FGFR boð eru mikilvæg fyrir útbreiðslu krabbameinsfrumna, flæði, æðamyndun og lifun; FGFR breytingar hafa orðið klínískt áhrifaríkar í auknum fjölda krabbameinstegunda. Þessi rannsókn metin tíðni og lýsingu á fjölmörgum FGF/FGFR breytingum í yfir 12,000 ífarandi brjóstakrabbameini og undirstrikaði hina gríðarlegu misleitni FGF/FGFR breytinga í ýmsum vefja- og sameindaundirgerðum sem og mismunandi meinvörpum brjóstakrabbameins. Ennfremur voru tengsl FGFR breytinga og ónæmi fyrir meðferðum sýnd í stórum klínískum gagnagrunni með samsvörun sameinda niðurstöður.

• Erfðafræðilegir og ónæmiseiginleikar EGFR undirtegunda í lungnakrabbameini sem ekki er af smáfrumugerð (NSCLC) (ágrip #4119) Þó að EGFR stökkbreytt NSCLC æxli séu almennt ónæm fyrir PD-1/PD-L1 hemlum, getur lítill undirhópur sjúklinga haft varanleg svörun . EGFR-stökkbreytt æxli sýna verulegan sameindamisleitni, hins vegar er skortur á skýrleika um erfðafræðilega og ónæmissnið EGFR stökkbreytinga undirtegunda, og frekari útskýring á þessu getur hjálpað til við að bera kennsl á sjúklinga sem eru líklegir til að svara ónæmisbundnum meðferðum. Með því að nýta fjöl-omic sameindagögnin sem myndast með næstu kynslóðar raðgreiningu á DNA og RNA á stórum hópi NSCLC æxla, staðfestir þessi rannsókn minnkað ónæmingargetu sem tengist flestum undirtegundum EGFR stökkbreytinga sem koma fram með lífmerkjum þar á meðal PD-L1, TMB og CD8+ T frumuíferð; og sýnir sjaldgæfar EGFR stökkbreytingar í tengslum við hagstæð ónæmissnið sem gæti bent til svörunar við ónæmismeðferð.